Depois de unificar o santuário, derrotar o imperador dos mares, o deus Poseidon, e o imperador do inferno, o deus Hades, começa a nova saga dos Cavaleiros do Zodíaco.
Cavaleiros do Zodíaco: Prólogo do Céu – Abertura começa com o Seiya paraplégico. Seu corpo, inerte, retrata o estado de seu espírito: ele está totalmente sem consciência. Três estranhos cavaleiros chegam e o atacam com farpas de madeira. As estacas ferem Seiya gravemente, mas não chegam a matá-lo, como era o esperado.
Um dos cavaleiros sente a presença de alguém protegendo Seiya e o ataca. Saori se revela e, com seu cosmo, elimina as farpas. Os cavaleiros não conseguem atacá-lo, porém logo chegam reforços.
O novo filme traz os heróis em temática mais adulta, o que não agradou boa parte dos fãs japoneses, mas não impediu o sucesso da produção. Esse não é um filme de Cavaleiros como os outros.
Alias, a produção pouco se assemelha com qualquer outra parte da obra. Saindo das suas raízes "lógicas", onde se podia prever praticamente tudo que aconteceria nos próximos episódios, o filme gira em torno de dúvidas que ficaram após o fim do terceiro capítulo e, surpreendentemente, termina deixando mais dúvidas ainda.
Muitos mistérios do começo do filme, como o fato de Seiya estar paraplégico e, do nada, se levantar e lutar contra os anjos, só são respondidos perto do final e, mesmo assim, restam algumas dúvidas.